1.装拆箱的主体不同

整箱货多数是由托运人装箱点数并加封后搬进一个集装箱场，到目的港的集装箱场交给收货人。其拆箱一般也是由收货人自行办理。拼箱货则大多由CFS装箱，到达目的地后，也是由CFS拆箱取出货物后再分别交给各收货人。

2.承运人的责任承担不同

对整箱货而言，承运人对整箱货是以箱作为交接单位，只要集装箱外表与收箱时相似，并铅封完整，承运人就完成了承运责任。承运人并不负责箱内货物的货损货差。因此整箱货运输的提单上，通常都要加上“托运人装箱点数并加铅封”的条款。拼箱货则与之不同。

3.运费标准不同

因为整箱货运输减少了船公司的手续，故某些航运公会对整箱货运输会有运费折扣。而拼箱货，通常航运公会要收取一定的集装箱货运站服务费。有一些海运公司的运输表中规定，对于拼箱货使用集装箱的容积有一个最低限度，装载量不得低于这一限度，如装载数量低于这一最低限度，托运人也必须按这一最低限度的装载量付费(未被使用的也需付费)，并通常按箱内货物最高运费率计收。